WormBase Tree Display for Variation: WBVar01516101
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WBVar01516101 | Name | Public_name | WBVar01516101 | |||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Other_name | cewivar00039874 | |||||||
C11D2.6c.1:c.1242T>A | ||||||||
C11D2.6o.1:c.1440T>A | ||||||||
C11D2.6n.1:c.1440T>A | ||||||||
CE48950:p.Leu414= | ||||||||
CE49437:p.Leu474= | ||||||||
C11D2.6g.1:c.1422T>A | ||||||||
CE49155:p.Leu462= | ||||||||
C11D2.6e.1:c.1422T>A | ||||||||
C11D2.6k.1:c.1386T>A | ||||||||
CE48791:p.Leu474= | ||||||||
CE49351:p.Leu480= | ||||||||
CE49195:p.Leu480= | ||||||||
CE49459:p.Leu462= | ||||||||
C11D2.6p.1:c.1440T>A | ||||||||
CE48978:p.Leu414= | ||||||||
C11D2.6a.1:c.1422T>A | ||||||||
C11D2.6f.1:c.1242T>A | ||||||||
C11D2.6m.1:c.1440T>A | ||||||||
CE48883:p.Leu414= | ||||||||
CE48736:p.Leu474= | ||||||||
C11D2.6i.1:c.1386T>A | ||||||||
C11D2.6j.1:c.1386T>A | ||||||||
C11D2.6h.1:c.1242T>A | ||||||||
CE49413:p.Leu480= | ||||||||
CE37196:p.Leu474= | ||||||||
C11D2.6b.1:c.1242T>A | ||||||||
C11D2.6d.1:c.1422T>A | ||||||||
CE49219:p.Leu462= | ||||||||
CE49180:p.Leu414= | ||||||||
CE49197:p.Leu462= | ||||||||
C11D2.6l.1:c.1386T>A | ||||||||
CE49262:p.Leu480= | ||||||||
HGVSg | CHROMOSOME_IV:g.6168124A>T | |||||||
Sequence_details | SMap | S_parent | Sequence | C11D2 | ||||
Flanking_sequences | AAGAATCTTGATGATACATTCAACATTGAA | AGTATTGTGAATCCAACTTCGAAAAGATAA | ||||||
Mapping_target | C11D2 | |||||||
Source_location | 225 | CHROMOSOME_IV | 6168113 | 6168113 | From_analysis | Million_mutation_project_reanalysis | ||
Type_of_mutation | Substitution | A | T | |||||
SeqStatus | Sequenced | |||||||
Variation_type | Natural_variant | |||||||
Origin | Species | Caenorhabditis elegans | ||||||
Strain | WBStrain00000032 | From_analysis | Million_mutation_project_reanalysis | |||||
WBStrain00022868 | From_analysis | Million_mutation_project_reanalysis | ||||||
WBStrain00022899 | From_analysis | Million_mutation_project_reanalysis | ||||||
WBStrain00023286 | From_analysis | Million_mutation_project_reanalysis | ||||||
Laboratory | VC | |||||||
Analysis | Million_mutation_project_reanalysis | |||||||
Status | Live | |||||||
Affects | Gene | WBGene00006809 | ||||||
Transcript | C11D2.6b.1 | VEP_consequence | synonymous_variant | |||||
VEP_impact | LOW | |||||||
HGVSc | C11D2.6b.1:c.1242T>A | |||||||
HGVSp | CE48883:p.Leu414= | |||||||
cDNA_position | 1242 | |||||||
CDS_position | 1242 | |||||||
Protein_position | 414 | |||||||
Exon_number | 8/27 | |||||||
Codon_change | ctT/ctA | |||||||
Amino_acid_change | L | |||||||
C11D2.6i.1 | VEP_consequence | synonymous_variant | ||||||
VEP_impact | LOW | |||||||
HGVSc | C11D2.6i.1:c.1386T>A | |||||||
HGVSp | CE49155:p.Leu462= | |||||||
cDNA_position | 1386 | |||||||
CDS_position | 1386 | |||||||
Protein_position | 462 | |||||||
Exon_number | 9/29 | |||||||
Codon_change | ctT/ctA | |||||||
Amino_acid_change | L | |||||||
C11D2.6a.1 | VEP_consequence | synonymous_variant | ||||||
VEP_impact | LOW | |||||||
HGVSc | C11D2.6a.1:c.1422T>A | |||||||
HGVSp | CE48736:p.Leu474= | |||||||
cDNA_position | 1525 | |||||||
CDS_position | 1422 | |||||||
Protein_position | 474 | |||||||
Exon_number | 10/30 | |||||||
Codon_change | ctT/ctA | |||||||
Amino_acid_change | L | |||||||
C11D2.6l.1 | VEP_consequence | synonymous_variant | ||||||
VEP_impact | LOW | |||||||
HGVSc | C11D2.6l.1:c.1386T>A | |||||||
HGVSp | CE49197:p.Leu462= | |||||||
cDNA_position | 1386 | |||||||
CDS_position | 1386 | |||||||
Protein_position | 462 | |||||||
Exon_number | 9/28 | |||||||
Codon_change | ctT/ctA | |||||||
Amino_acid_change | L | |||||||
C11D2.6e.1 | VEP_consequence | synonymous_variant | ||||||
VEP_impact | LOW | |||||||
HGVSc | C11D2.6e.1:c.1422T>A | |||||||
HGVSp | CE48791:p.Leu474= | |||||||
cDNA_position | 1422 | |||||||
CDS_position | 1422 | |||||||
Protein_position | 474 | |||||||
Exon_number | 9/28 | |||||||
Codon_change | ctT/ctA | |||||||
Amino_acid_change | L | |||||||
C11D2.6g.1 | VEP_consequence | synonymous_variant | ||||||
VEP_impact | LOW | |||||||
HGVSc | C11D2.6g.1:c.1422T>A | |||||||
HGVSp | CE49437:p.Leu474= | |||||||
cDNA_position | 1422 | |||||||
CDS_position | 1422 | |||||||
Protein_position | 474 | |||||||
Exon_number | 9/28 | |||||||
Codon_change | ctT/ctA | |||||||
Amino_acid_change | L | |||||||
C11D2.6m.1 | VEP_consequence | synonymous_variant | ||||||
VEP_impact | LOW | |||||||
HGVSc | C11D2.6m.1:c.1440T>A | |||||||
HGVSp | CE49195:p.Leu480= | |||||||
cDNA_position | 1440 | |||||||
CDS_position | 1440 | |||||||
Protein_position | 480 | |||||||
Exon_number | 10/30 | |||||||
Codon_change | ctT/ctA | |||||||
Amino_acid_change | L | |||||||
C11D2.6k.1 | VEP_consequence | synonymous_variant | ||||||
VEP_impact | LOW | |||||||
HGVSc | C11D2.6k.1:c.1386T>A | |||||||
HGVSp | CE49459:p.Leu462= | |||||||
cDNA_position | 1386 | |||||||
CDS_position | 1386 | |||||||
Protein_position | 462 | |||||||
Exon_number | 9/28 | |||||||
Codon_change | ctT/ctA | |||||||
Amino_acid_change | L | |||||||
C11D2.6o.1 | VEP_consequence | synonymous_variant | ||||||
VEP_impact | LOW | |||||||
HGVSc | C11D2.6o.1:c.1440T>A | |||||||
HGVSp | CE49351:p.Leu480= | |||||||
cDNA_position | 1440 | |||||||
CDS_position | 1440 | |||||||
Protein_position | 480 | |||||||
Exon_number | 10/29 | |||||||
Codon_change | ctT/ctA | |||||||
Amino_acid_change | L | |||||||
C11D2.6p.1 | VEP_consequence | synonymous_variant | ||||||
VEP_impact | LOW | |||||||
HGVSc | C11D2.6p.1:c.1440T>A | |||||||
HGVSp | CE49413:p.Leu480= | |||||||
cDNA_position | 1440 | |||||||
CDS_position | 1440 | |||||||
Protein_position | 480 | |||||||
Exon_number | 10/29 | |||||||
Codon_change | ctT/ctA | |||||||
Amino_acid_change | L | |||||||
C11D2.6f.1 | VEP_consequence | synonymous_variant | ||||||
VEP_impact | LOW | |||||||
HGVSc | C11D2.6f.1:c.1242T>A | |||||||
HGVSp | CE48950:p.Leu414= | |||||||
cDNA_position | 1242 | |||||||
CDS_position | 1242 | |||||||
Protein_position | 414 | |||||||
Exon_number | 8/26 | |||||||
Codon_change | ctT/ctA | |||||||
Amino_acid_change | L | |||||||
C11D2.6d.1 | VEP_consequence | synonymous_variant | ||||||
VEP_impact | LOW | |||||||
HGVSc | C11D2.6d.1:c.1422T>A | |||||||
HGVSp | CE37196:p.Leu474= | |||||||
cDNA_position | 1422 | |||||||
CDS_position | 1422 | |||||||
Protein_position | 474 | |||||||
Exon_number | 9/29 | |||||||
Codon_change | ctT/ctA | |||||||
Amino_acid_change | L | |||||||
C11D2.6c.1 | VEP_consequence | synonymous_variant | ||||||
VEP_impact | LOW | |||||||
HGVSc | C11D2.6c.1:c.1242T>A | |||||||
HGVSp | CE48978:p.Leu414= | |||||||
cDNA_position | 1242 | |||||||
CDS_position | 1242 | |||||||
Protein_position | 414 | |||||||
Exon_number | 8/29 | |||||||
Codon_change | ctT/ctA | |||||||
Amino_acid_change | L | |||||||
C11D2.6h.1 | VEP_consequence | synonymous_variant | ||||||
VEP_impact | LOW | |||||||
HGVSc | C11D2.6h.1:c.1242T>A | |||||||
HGVSp | CE49180:p.Leu414= | |||||||
cDNA_position | 1242 | |||||||
CDS_position | 1242 | |||||||
Protein_position | 414 | |||||||
Exon_number | 8/27 | |||||||
Codon_change | ctT/ctA | |||||||
Amino_acid_change | L | |||||||
C11D2.6n.1 | VEP_consequence | synonymous_variant | ||||||
VEP_impact | LOW | |||||||
HGVSc | C11D2.6n.1:c.1440T>A | |||||||
HGVSp | CE49262:p.Leu480= | |||||||
cDNA_position | 1440 | |||||||
CDS_position | 1440 | |||||||
Protein_position | 480 | |||||||
Exon_number | 10/28 | |||||||
Codon_change | ctT/ctA | |||||||
Amino_acid_change | L | |||||||
C11D2.6j.1 | VEP_consequence | synonymous_variant | ||||||
VEP_impact | LOW | |||||||
HGVSc | C11D2.6j.1:c.1386T>A | |||||||
HGVSp | CE49219:p.Leu462= | |||||||
cDNA_position | 1386 | |||||||
CDS_position | 1386 | |||||||
Protein_position | 462 | |||||||
Exon_number | 9/27 | |||||||
Codon_change | ctT/ctA | |||||||
Amino_acid_change | L | |||||||
Method | WGS_Flibotte |