WormBase Tree Display for Sequence: C31H1
expand all nodes | collapse all nodes | view schema
| C31H1 | DNA | C31H1 | 39916 | |||
|---|---|---|---|---|---|---|
| SMap | S_child | Gene_child (94) | ||||
| CDS_child (163) | ||||||
| Transcript | C31H1.6d | 30816 | 25896 | |||
| C31H1.9 | 1174 | 1194 | ||||
| C31H1.10 | 892 | 912 | ||||
| C31H1.11 | 12889 | 12909 | ||||
| C31H1.12 | 13156 | 13136 | ||||
| C31H1.13 | 33339 | 33319 | ||||
| C31H1.14 | 23169 | 23189 | ||||
| C31H1.15 | 28970 | 28990 | ||||
| C31H1.16 | 28571 | 28551 | ||||
| C31H1.17 | 27753 | 27733 | ||||
| C31H1.18 | 22406 | 22386 | ||||
| C31H1.19 | 10373 | 10393 | ||||
| C31H1.20 | 34878 | 34858 | ||||
| C31H1.21 | 2595 | 2575 | ||||
| C31H1.22 | 20811 | 20831 | ||||
| C31H1.23 | 13307 | 13327 | ||||
| C31H1.24 | 36096 | 36076 | ||||
| C31H1.25 | 35783 | 35763 | ||||
| C31H1.26 | 15422 | 15402 | ||||
| C31H1.27 | 31354 | 31334 | ||||
| C31H1.28 | 29992 | 29972 | ||||
| C31H1.29 | 20240 | 20260 | ||||
| C31H1.30 | 32151 | 32171 | ||||
| C31H1.31 | 16829 | 16849 | ||||
| C31H1.32 | 770 | 790 | ||||
| C31H1.33 | 26257 | 26277 | ||||
| C31H1.34 | 4316 | 4336 | ||||
| C31H1.35 | 12482 | 12502 | ||||
| C31H1.36 | 5202 | 5182 | ||||
| C31H1.37 | 31455 | 31435 | ||||
| C31H1.38 | 12727 | 12707 | ||||
| C31H1.39 | 2598 | 2578 | ||||
| C31H1.40 | 12643 | 12663 | ||||
| C31H1.41 | 31764 | 31784 | ||||
| C31H1.42 | 26135 | 26155 | ||||
| C31H1.43 | 24801 | 24821 | ||||
| C31H1.44 | 14316 | 14296 | ||||
| C31H1.45 | 29065 | 29085 | ||||
| C31H1.46 | 4672 | 4692 | ||||
| C31H1.47 | 4597 | 4617 | ||||
| C31H1.48 | 769 | 789 | ||||
| C31H1.49 | 34193 | 34173 | ||||
| C31H1.50 | 32150 | 32170 | ||||
| C31H1.51 | 1171 | 1191 | ||||
| C31H1.52 | 33759 | 33779 | ||||
| C31H1.53 | 2873 | 2893 | ||||
| C31H1.54 | 15328 | 15348 | ||||
| C31H1.55 | 8988 | 8968 | ||||
| C31H1.56 | 25307 | 25327 | ||||
| C31H1.57 | 18791 | 18811 | ||||
| C31H1.58 | 34412 | 34392 | ||||
| C31H1.59 | 16291 | 16311 | ||||
| C31H1.60 | 27756 | 27736 | ||||
| C31H1.61 | 33947 | 33927 | ||||
| C31H1.62 | 29991 | 29971 | ||||
| C31H1.63 | 8443 | 8463 | ||||
| C31H1.64 | 34614 | 34594 | ||||
| C31H1.65 | 14317 | 14297 | ||||
| C31H1.66 | 23170 | 23190 | ||||
| C31H1.67 | 2596 | 2576 | ||||
| C31H1.68 | 25306 | 25326 | ||||
| C31H1.69 | 28215 | 28195 | ||||
| C31H1.70 | 3706 | 3726 | ||||
| C31H1.71 | 34411 | 34391 | ||||
| C31H1.72 | 2870 | 2890 | ||||
| C31H1.73 | 4956 | 4976 | ||||
| C31H1.74 | 14511 | 14531 | ||||
| C31H1.75 | 17309 | 17289 | ||||
| C31H1.76 | 32761 | 32781 | ||||
| C31H1.77 | 33023 | 33043 | ||||
| C31H1.78 | 13308 | 13328 | ||||
| C31H1.79 | 2013 | 1993 | ||||
| C31H1.80 | 34613 | 34593 | ||||
| C31H1.81 | 28568 | 28548 | ||||
| C31H1.82 | 17739 | 17759 | ||||
| C31H1.83 | 6350 | 6330 | ||||
| C31H1.84 | 25745 | 25765 | ||||
| C31H1.85 | 33552 | 33532 | ||||
| C31H1.86 | 27754 | 27734 | ||||
| C31H1.87 | 8437 | 8457 | ||||
| C31H1.88 | 26848 | 26828 | ||||
| C31H1.89 | 28211 | 28191 | ||||
| C31H1.90 | 12726 | 12706 | ||||
| C31H1.91 | 6787 | 6767 | ||||
| C31H1.92 | 22409 | 22389 | ||||
| C31H1.93 | 16523 | 16503 | ||||
| C31H1.94 | 14736 | 14716 | ||||
| C31H1.95 | 17363 | 17383 | ||||
| C31H1.96 | 28477 | 28619 | ||||
| C31H1.97 | 36594 | 36750 | ||||
| C31H1.1.1 | 22838 | 25618 | ||||
| C31H1.2.1 | 16678 | 18842 | ||||
| C31H1.5.1 | 22179 | 20317 | ||||
| C31H1.6a.1 | 32478 | 25721 | ||||
| C31H1.6b.1 | 30816 | 25896 | ||||
| C31H1.6c.1 | 27505 | 25896 | ||||
| C31H1.8a.1 | 39527 | 36968 | ||||
| C31H1.8b.1 | 39112 | 37326 | ||||
| C31H1.8c.1 | 39527 | 36967 | ||||
| C31H1.8d.1 | 39112 | 37326 | ||||
| Transposon | WBTransposon00000423 | 19243 | 19801 | |||
| PCR_product (25) | ||||||
| Allele (404) | ||||||
| Oligo_set | Aff_C31H1.1 | 24701 | 25542 | |||
| Aff_C31H1.2 | 16695 | 18812 | ||||
| Aff_C31H1.3 | 19224 | 19664 | ||||
| Aff_C31H1.5 | 21237 | 20378 | ||||
| Aff_C31H1.6 | 27712 | 25896 | ||||
| Aff_C31H1.7 | 35688 | 33965 | ||||
| Aff_C31H1.8 | 38121 | 37326 | ||||
| Feature_object (251) | ||||||
| Feature_data | C31H1:Polysome | 1 | 39916 | |||
| C31H1:TranscriptionallyActiveRegion | 1 | 39916 | ||||
| C31H1:ChIPSeqTF | 1 | 39916 | ||||
| C31H1:TRF | 1 | 39916 | ||||
| C31H1:Dust | 1 | 39916 | ||||
| C31H1:inverted | 1 | 39916 | ||||
| Homol_data (16) | ||||||
| Structure | From | Source | CHROMOSOME_IV | |||
| Overlap_right | C10G6 | 39717 | ||||
| Overlap_left | F44E8 | |||||
| Clone_left_end | C10G6 | 39717 | ||||
| C31H1 | 197 | |||||
| Clone_right_end | F44E8 | 13733 | ||||
| C45E5 | 485 | |||||
| DB_info | Database | EMBL | NDB_AC | FO080496 | ||
| NDB_ID | _U42848 | |||||
| NDB_SV | FO080496.1 | |||||
| Secondary_accession | U42848 | |||||
| DB_remark | The 5' clone is F44E8, 200 bp overlap; the 3' clone is C10G6, 200 bp overlap. Actual start of this clone is at base position 197 of C31H1; actual end is at 3233 of C10G6. | |||||
| Keyword | HTG | |||||
| EMBL_dump_info | EMBL_dump_method | worm_EMBL-dump | ||||
| Origin | From_author | Leimbac D | ||||
| Leimbach D | ||||||
| From_laboratory | RW | |||||
| Date | 01 Dec 1995 00:00:00 | |||||
| Date_directory | 951130 | |||||
| Species | Caenorhabditis elegans | |||||
| Visible | Clone | C31H1 | ||||
| Properties | Genomic_canonical | |||||
| Checksum | MD5 | 5dc2bc9ca2823616ae038c0f978b6c49 | ||||
| Status | Shotgun | |||||
| Finished | ||||||
| Submitted | 01 Dec 1995 00:00:00 | |||||
| Map | Sequence-IV | |||||
| Interpolated_map_position | IV | 2.30469 | ||||
| Method | Genomic_canonical |
