WormBase Tree Display for Protein: RP48827
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| RP48827 | Peptide | RP48827 | 365 | -2025207328 | |||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| DB_info | Database | EnsEMBLGenomes | EnsEMBL_protein_id | CRE15280 | |||||
| Gene_name | Cre-ZTF-14.2 | ||||||||
| Molecular_weight | 41 | Inferred_automatically | build_pepace.pl | ||||||
| Origin | Species | Caenorhabditis remanei | |||||||
| Wormpep | |||||||||
| History | 193 | created | CRE15280 | ||||||
| Live | |||||||||
| Visible | Corresponding_CDS | CRE15280 | |||||||
| Homology_group | COG5048 | ||||||||
| KOG1721 | |||||||||
| Homol | Pep_homol (186) | ||||||||
| Motif_homol | HMMPANTHER:PTHR19818 | hmmpanther | 219.5 | 8 | 336 | 174 | 474 | ||
| PFSCAN:PS50157 | pfscan | 0 | 307 | 337 | 0 | 0 | |||
| 155 | 184 | 0 | 0 | ||||||
| 261 | 287 | 0 | 0 | ||||||
| 233 | 260 | 0 | 0 | ||||||
| SCANPROSITE:PS00028 | scanprosite | 0 | 309 | 332 | 0 | 0 | |||
| 263 | 286 | 0 | 0 | ||||||
| 157 | 179 | 0 | 0 | ||||||
| SMART:SM00355 | smart | 95.3 | 155 | 179 | 1 | 23 | |||
| 261 | 286 | 1 | 23 | ||||||
| 307 | 332 | 1 | 23 | ||||||
| 185 | 210 | 1 | 23 | ||||||
| 233 | 255 | 1 | 23 | ||||||
| PFAM:PF00096 | pfam | 56.5 | 307 | 332 | 1 | 23 | |||
| 237 | 255 | 5 | 23 | ||||||
| SUPERFAMILY:SSF57667 | superfamily | 0 | 305 | 331 | 0 | 0 | |||
| 175 | 220 | 0 | 0 | ||||||
| 242 | 288 | 0 | 0 | ||||||
| 148 | 181 | 0 | 0 | ||||||
| INTERPRO:IPR013087 | interpro | 0 | 155 | 179 | 1 | 23 | |||
| 185 | 210 | 1 | 23 | ||||||
| 233 | 255 | 1 | 23 | ||||||
| 261 | 286 | 1 | 23 | ||||||
| 307 | 332 | 1 | 23 | ||||||
| INTERPRO:IPR036236 | interpro | 1e-06 | 148 | 220 | 0 | 0 | |||
| 0 | 242 | 288 | 0 | 0 | |||||
| 2e-06 | 305 | 331 | 0 | 0 | |||||
| Homol_homol | Y47D3A:wublastx_remanei | ||||||||
| M163:wublastx_remanei | |||||||||
| Crem_Contig12:wublastx_remanei | |||||||||
| Crem_Contig11:wublastx_remanei | |||||||||
| Crem_Contig233:wublastx_remanei |
